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Job description
Vous êtes passionné·e par la recherche biomédicale et souhaitez contribuer à la découverte de nouvelles cibles thérapeutiques pour des maladies neurodégénératives encore incurables ? Rejoignez un projet de thèse innovant, placé à l’intersection de la biologie cellulaire, de la génomique spatiale et de la modélisation fonctionnelle.
Dans le cadre d’une collaboration franco‑belge‑britannique entre le laboratoire du Prof. Albena Jordanova (VIB‑UAntwerp) et le laboratoire de l’Assist. Prof. Csilla Varnai (University of Birmingham), vous étudierez des biopsies nerveuses de patients atteints de la neuropathie Charcot‑Marie‑Tooth (CMT) liée à des mutations du gène YARS1. Vous disposerez d’un panel complet de modèles – biopsies humaines, neurones moteurs dérivés d’iPSC, drosophiles et levures – pour décrypter les mécanismes pathologiques à l’échelle spatiale grâce aux technologies multi‑omics (spatial transcriptomics, proteomics, épigénomique).
**Missions principales**
- Préparer et analyser des coupes tissulaires de biopsies nerveuses et de cultures iPSC pour des expériences de spatial omics.
- Mettre en place les pipelines bioinformatiques de traitement, d’intégration et de visualisation des données multi‑omics (Python, R, Galaxy, Seurat, Scanpy, etc.).
- Comparer les signatures moléculaires obtenues avec les modèles Drosophila et levure afin d’identifier des voies communes de dégénérescence axonale.
- Contribuer à la rédaction d’articles scientifiques, de rapports de financement et de présentations lors de conférences internationales.
- Travailler en étroite collaboration avec les équipes cliniques, de biologie cellulaire et de génétique pour assurer la cohérence des expériences et l’interprétation des résultats.
**Profil recherché**
- Diplôme de Master (ou équivalent) en biologie, biochimie, génétique, bioinformatique ou disciplines connexes.
- Expérience pratique en techniques de biologie moléculaire (extraction d’ARN/ADN, PCR, culture cellulaire) et/ou en microscopie.
- Connaissances solides en analyse de données omiques (RNA‑seq, ATAC‑seq, proteomics) et maîtrise d’au moins un langage de programmation (Python ou R).
- Curiosité scientifique, esprit d’analyse et capacité à travailler de façon autonome tout en étant intégré·e à une équipe multidisciplinaire.
- Bon niveau d’anglais écrit et oral (communication scientifique).
**Ce que nous offrons**
- Un encadrement de haut niveau par deux leaders reconnus dans le domaine de la neurodégénérescence.
- Accès à des plateformes technologiques de pointe (10x Genomics, NanoString, confocal, etc.).
- Financement complet du doctorat (bourse Generet Award for Rare Diseases 2025, King Baudouin Foundation) incluant un salaire compétitif, les frais de déplacement et les frais de conférence.
- Environnement de travail stimulant au sein du VIB, centre de recherche biomédicale de renommée internationale, et à l’Université de Birmingham.
- Opportunités de publier dans des revues à fort impact et de développer un réseau professionnel solide.
Rejoignez-nous pour transformer des observations cliniques en découvertes fondamentales et ouvrir la voie à de nouvelles stratégies thérapeutiques contre la CMT et d’autres neuropathies dégénératives.
