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Job description
NHS Greater Glasgow and Clyde (NHSGGC) est l’un des plus grands systèmes de santé du Royaume-Uni, regroupant près de 40 000 collaborateurs aux compétences variées, tant cliniques que non‑cliniques. Dans le cadre de son ambition d’offrir des diagnostics génomiques de pointe, le département du Laboratoire de Génétique, situé à l’hôpital universitaire Queen Elizabeth, recrute un·e Bioinformaticien·ne expérimenté·e.
En tant que pilier technique du service, vous serez chargé·e de concevoir, développer, maintenir et valider des pipelines bioinformatiques dédiés à l’analyse de données de séquençage de nouvelle génération (NGS). Vous transformerez des jeux de données brutes (FASTQ, BAM, VCF) en rapports cliniques annotés, en veillant à la conformité avec les normes de qualité, les exigences d’accréditation (ISO 15189) et les réglementations de gouvernance des données (GDPR). Vous assurerez le suivi de la qualité des données, la mise en place de contrôles de version (Git), de systèmes de traçabilité et de documentation complète afin de garantir la reproductibilité et la transparence des analyses.
Vous collaborerez étroitement avec les scientifiques, les généticiens cliniques et les équipes de pathologie pour interpréter les résultats, fournir des conseils spécialisés et contribuer à la rédaction de rapports de diagnostic. Vous participerez activement à l’évaluation et à l’intégration de nouveaux outils (ex. : GATK, DeepVariant, Snakemake, Nextflow) ainsi qu’à l’optimisation des workflows existants afin d’améliorer les temps de traitement et la précision des appels de variantes.
Le rôle implique également la formation et le transfert de compétences au sein du laboratoire : vous animerez des ateliers, rédigerez des guides d’utilisation et soutiendrez les collègues dans l’adoption des meilleures pratiques bioinformatiques. Vous serez un acteur clé de l’amélioration continue, en proposant des indicateurs de performance (KPIs), en menant des revues de processus et en participant aux audits internes et externes.
Ce poste offre une opportunité unique d’impacter directement la prise en charge des patients, en traduisant des données génomiques complexes en informations cliniques exploitables. Vous évoluerez dans un environnement multidisciplinaire, au sein d’une institution reconnue pour son excellence en recherche et en soins de santé, tout en développant une expertise pointue en bioinformatique génomique appliquée à la médecine de précision.
Profil recherché : diplôme de niveau Master ou Doctorat en bioinformatique, génétique, biologie computationnelle ou domaine connexe, avec au moins 5 ans d’expérience dans le traitement de données NGS en contexte clinique. Maîtrise des langages de programmation (Python, R, Bash), des systèmes de gestion de workflow (Snakemake, Nextflow, CWL) et des bases de données (SQL, NoSQL). Connaissance approfondie des outils d’alignement, d’appel de variantes et d’annotation (BWA, GATK, VEP, ANNOVAR). Expérience avérée en gestion de projets, documentation technique et conformité réglementaire. Excellent sens du travail d’équipe, capacité à communiquer des concepts complexes à des publics non‑techniques et volonté d’innover dans un cadre clinique.
Rejoignez NHSGGC et participez à la transformation digitale de la génétique médicale, au service d’une population de plus d’un million d’habitants. Nous offrons un contrat à durée indéterminée, un environnement de travail stimulant, des possibilités de formation continue et un package salarial compétitif.
